sábado, 31 de julho de 2021

PROTOCOLO CLÍNICO SIMBIÓTICO PARA PACIENTES NÃO HOPITALIZADOS DA COVID-19

 

Gilson Lima[1]


 SIMBIOGÊNESE. Covid-19. Uma doença do Sistema Imune de “algumas pessoas”.

Por que algumas pessoas? Por que mais de 40% das pessoas não tem a doença. Tem um sistema imune evoluído que dá conta da interação com o Sars-Cov-2 como tantos outros vírus que interagimos diariamente. 

 

Fase 01. CHAMAMOS DE FASE VIRAL

 

FASE VIRAL => É O MOMENTO DO CONTATO onde o vírus por via respiratória ultrapassa as barreiras de proteção e se instala inicialmente. Por via respiratória o paciente teve contato com o Sars-Cov-2.

Ele se localiza inicialmente nas vias nasais e na boca, às vezes chega até próximo à laringe dependendo da carga viral. Então, nesse momento a carga viral é fundamental. Algumas variantes, as mais potentes, são capazes de replicar mais rápido e com baixa carga viral já traz bastante complicações para a ação inicial do sistema imune inato.

O vírus começa a interagir com o sistema imune inato que – em geral – reconhece adequadamente o patógeno e começa a agir. A grande maioria das pessoas, seu sistema imune dará conta da interação com o vírus e muitas nem sequer terão algum sintoma inflamatório. O sistema imune agirá adequadamente como faz para a maioria dos vírus.

A grande maioria das pessoas não terá sintoma algum. Não terá a doença. Seu sistema imune é avançado suficiente para dar conta desse vírus sem transtornos maiores para seu organismo.

Algumas pessoas terão sintomas leves como mal estar um pouco de dor de cabeça e até uma febrícula. Alguns terão em poucos dias uma recuperação. Pode ocorrer depois dos sintomas leves algumas micro sequelas como desordens no paladar e no olfato que com um tratamento aromático (já indicado no meu blog) resolverá para a grande maioria das pessoas. Porque essas lesões serão nas células neuronais locais e não no córtex cerebral que é mais complicado.

 

RECOMENDAÇÕES. Nessa fase recomenda-se repouso, muito liquido (água).... Antitérmicos tipo paracetamol. Se for usar anti-inflamatório leves como dipirona ou Ibuprofeno tudo bem, não temos relatos de interação medicamentosa entre a dipirona e o ibuprofeno. Mas é importante que um médico avalie cada situação, já que ambas as medicações têm contraindicações formais.

Isolamento para impedir o contágio. O vetor de contágio desse vírus são os humanos e o veículo o ar.

Tenha em mãos ou adquire um oxímetro de dedo. Por quê? Mesmo não tendo falta de ar você pode estar saturando o oxigênio no sangue e isso é chave para saber a quanto anda a situação da doença no seu corpo.

3 vezes por dia verifique a oxigenação do sangue. A situação sadia é os aparelhos tem que marcar em 95 de oxigenação. Se baixar de 93 e persistir está na hora de agir. Procure um médico. 

Está entrando na fase 2 da doença. Chamo de fase inflamatória.

Se começar sentir sintomas mais graves de enfraquecimento, etc... o processo inflamatório está começando com mais intensidade. Passamos de fase.

 

FASE 02 => FASE INFLAMATÓRIA

 

Em média ocorre em torno de 7 dias dos primeiros sintomas. É o momento chave de agir. Aqui evitaremos hospitalizações e agravamento da doença. O centro da atividade da doença é o próprio corpo. Ele se desorganiza e resolve atacar o vírus com armas mais potentes do que seria necessário. É um erro, geralmente molecular ou vinculado ao desgaste de da idade, morbidades, etc. Em situações normais não acontecerá a doença e se acontecer não passará da fase 1 que é a viral.

A desorganização ocorre com uma tempestade de citocinas. São moléculas que induzem a inflamação. Essa desorganização de moléculas inflamatórias principalmente a interleucina IL-6 e também a interleucina (IL) 1 beta (IL-1β)- essa última que envolve mais os processos de diabetes de tipo 2 e que causam essa a doença.

 

RECOMENDAÇÕES

Consulte seu médico. É o momento certo dele entrar com a Budesonida 400mcg (Busonide Caps ou Miflonide)...............60 cápsulas

Com aparelho para inalação - inale duas cápsulas (uma e depois a outra) duas vezes ao dia por 10 a 14 dias (conforme evolução).


Fonte. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S2213260021001600

 Diante do boicote dessa solução resolvi divulgar.  Pesquisas inglesas no início de 2020 detectaram um medicamento que evitaria muito as hospitalizações. É seguro. Não tem patente. Barato. Salva vidas e é uma descoberta desde março de 2020. O mais interessante é que não é divulgado. Por que será?   https://glolima.blogspot.com/2021/07/composto-utilizado-para-asma-evita.html

 Consulte sempre o médico. É preciso ter um protocolo de monitoramento clínico.  Todos medicamentos tem pessoas que não podem utilizar. Além de ter que utilizar no momento certo.

No início da fase inflamatória. Budesonida. Só se adquire com receita.

A administração precoce de budesonida inalada reduziu a probabilidade de necessidade de cuidados médicos urgentes e reduziu o tempo de recuperação após a infecção precoce por COVID-19.

O problema é que como cientista sempre vi isso. A ciência está sempre na frente do ensino. Muitos médicos, inclusive, intensivistas não sabem disso. Tudo está muito rápido. A divulgação ajuda. Fora o boicote também como já afirmei. Que não é de hoje e nem dessa pandemia.


Continua com muito líquido e repouso. 

A grande maioria dos pacientes se agirem no momento certo ficarão até a fase 2 e vão aos poucos se recuperando. Alguns, poucos podem ir adiante e agravar. Entram na fase 3.

  

MAIS REFERÊNCIAS:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/all.14850

Silenciamento de SARS-CoV-2 com formulação de dendrímero de peptídeo de siRNA modificada

 University Oxford

https://www.ox.ac.uk/news/2021-02-10-drug-trial-could-improve-respiratory-recovery-covid-19-now-underway

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.02.04.21251134v1

 

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FASE 03

Pré-hospitalar. As coisas estão mais complicadas e será necessário entrar com Corticoide sistêmico e, muitas vezes, com auxílio de oxigênio artificial para dormir a noite.

Sendo monitorado por um médico de modo constante não se faz necessário ainda baixa hospitalar. Mas é um momento crítico. Tem que estar atento e até fazer exames de sangue e de imagem do pulmão para avaliações.

Continue sempre  com o monitoramento do oxímetro.

Nada de utilizar antibiótico com drogas para vírus, vírus não tem vida. Não tem como funcionar (bio = vida. Anti-bio), não funciona em vírus.

Padrão de descanso absoluto. Repouso.

Muita água. 

Referências:

Tocilizumabe em pacientes internados no hospital com COVID-19 (RECUPERAÇÃO): um ensaio de plataforma randomizado, controlado, aberto

Link  https://www.thelancet.com/journals/lanres/article/PIIS2213-2600(21)00139-9/fulltext

Bloqueio do receptor de interleucina-6 em pacientes com COVID-19: contextualizando os ensaios clínicos

Link

https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(21)00273-4?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124721002734%3Fshowall%3Dtrue 

As telas de reaproveitamento de drogas revelam vias de entrada específicas do tipo de célula e drogas aprovadas pela FDA ativas contra SARS-Cov-2

LINK

https://www.thelancet.com/journals/lanres/article/PIIS2213-2600(21)00160-0/fulltext

 

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FASE 4 HOSPITALAR. Exigirá um novo protocolo que será ministrado por especialistas intensivistas.

 

 



[1] Gilson Lima. É cientista. Aposentou-se depois de décadas de atuação independente sobre múltiplos campos da vida e da tecnologia na complexidade. Hoje atua na ciência como atividade voluntária. Criou a teoria não natural da simbiogênese cooperativa na evolução cérebro, máquinas, corpos e sociedade. Foi por vários anos também pesquisador acadêmico e industrial coordenando bancadas de pesquisas de ciência de ponta, tecnologia e protocolos de neuroreabilitação em diferentes cidades e diferentes países, principalmente, europeus.

Tem formação original humanística e foi voltando seus estudos e pesquisas desde o início dos anos 90 para a abordagem da complexidade nas metodologias informacionais, depois na nanotecnologia e nos últimos 15 anos de carreira focou na neuroaprendizagem e reabilitação envolvendo a simbiogênese e interfaces colaborativas entre cérebro, corpos e displays.

Inventor de várias tecnologias, softwares e protocolos clínicos.

Escritor. Muitas de suas atividades e textos estão disponíveis no blog: http://glolima.blogspot.com

Atualmente retomou sua atividade como músico compositor, cantor de codinome Kowalsky, uma atividade que atuava na adolescência e atualmente produzindo suas canções e coordenando a Banda Seu Kowalsky e os Nômades de Pedra. Suas músicas e shows vídeos podem ser acessadas no canal do youtube. https://www.youtube.com/c/seukowalskyeosnomadesdepedra

quinta-feira, 15 de julho de 2021

Composto utilizado para a asma evita hospitalização e mostra o caminho do tratamento da COVID-19

 Gilson Lima - Kowalsky 🎤[1]


É um composto para Asma com efeitos anti-inflamatórios.

 

Budesonida

Então. Pesquisas inglesas no início de 2020 detectaram um medicamento que evitaria muito as hospitalizações. É seguro. Não tem patente. Barato. Salva vidas e é uma descoberta desde março de 2020. O mais interessante é que não é divulgado. Por que será?

Desde 2003  sabemos que Corona envolve uma doença do Sistema Imune. Desde o início sabemos que  a doença COVID-19 tem uma trilha do vírus que vai pelo caminho oral. Acho que não seria um bom negócio resolver a doença, por isso a indústria optou que o melhor caminho seria focar no vírus. 

Tenho dito desde o início que o  centro de Atividade da COVID-19 não é o vírus. O segredo da derrota da doença está em nós mesmos. A Chave é o sistema imune. O que está matando os humanos hoje é nosso próprio sistema imunológico, não tanto o vírus em si

O vírus produz um determinado quadro, que impõe, para alguns de nós, um stress ao sistema imunológico.  Uma super reação desorganizada. O sistema imunológico, ao super reagir, está causando as mortes.

Budesonida é uma medicação que já mostrou muito eficiente e impedindo evoluir a doença da fase viral e inflamatória inicial.

É em spray... usado para Asma... Acabou permitindo essas pesquisas - com essa medicação - descobrimos que a Asma não é fator de risco para a Covid-19, até porque, como temos afirmado  a Covid-19 não é uma doença pulmonar.

Usando essa medicação na fase inicial ela tem revelado ser uma grande esperança.

O caminho é por aí - inclusive - o ideal era esse o caminho das vacinas era terem sido orais, em gotas... defendemos isso, mas a indústria não aceitaram esse caminho. Uma pena.

O caminho do vírus é o segredo já que a Covid-19 é uma doença do sistema imune, de alguns. Não de todos. Porque para muitos nem existe, a doença ou seus efeitos na saúde são muito leves.

O certo é que, de imediato, Budesonida, esse corticoide oral, já é uma alternativa. 

Consulte seu médico. Tem um grupo de pessoas - como todos medicamentos tem - é contra indicada.

Consulte seu médico e fale sobre a Budesonida de 400 a 800 microgramas por aplicação e duas vezes por dia por cerca de 14 dias. 

A Budesonida vem com um aparelho de aplicação - deverá ser inalada duas cápsulas (uma e depois outra). A cápsula é um comprimido com um pó dentro. Você coloca dentro do inalador, ele estoura e se faz a aplicação em spray. Duas vezes aio dia.

Tem que usar na hora certa. Evita hospitalização. Evita oxigênio artificial. Depois que está em quadro hospitalar não adianta tem que ser corticoides mais sistêmicos.  Se usar no momento certo o risco hospitalar é praticamente zero tirando situações mais específicas de morbidade. Não tem patente. É muito barato. A difusão disso, por causa disso é quase nula. Mas todos que estudam a fundo já sabem...  ou deveriam saber...

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SOBRE AS VACINAS: Não temos saída hoje fora das vacinas musculares, mas lá atrás esse caminho foi fechado. Uma coisa é ciência e outra é tecnologias, patentes. Vocês devem saber disso.

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Links e referências mais atuais

Budesonida inalada no tratamento do COVID-19 precoce (STOIC): um ensaio clínico controlado randomizado de fase 2, aberto. Lancet Respir Med. 2021;(publicado online em 9 de abril de 2021). 

https://doi.org/10.1016/S2213-2600(21)00160-0 

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.04.10.21254672v1

 Artigo completo

Budesonida inalada para COVID-19 em pessoas com maior risco de resultados adversos na comunidade: análises provisórias do ensaio

Este artigo é uma pré-impressão e não foi revisado por pares [o que isso significa?]. Ele relata novas pesquisas médicas que ainda não foram avaliadas e, portanto, não devem ser usadas para orientar a prática clínica. 

Link  https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(21)00676-0/fulltext

 OXFORD 

https://www.ox.ac.uk/news/2021-04-12-asthma-drug-budesonide-shortens-recovery-time-non-hospitalised-patients-covid-19

 12/04/2021 

O medicamento para asma budesonida encurta o tempo de recuperação em pacientes não hospitalizados com COVID-19

Tocilizumabe em pacientes internados no hospital com COVID-19 (RECUPERAÇÃO): um ensaio de plataforma randomizado, controlado, aberto

Link  https://www.thelancet.com/journals/lanres/article/PIIS2213-2600(21)00139-9/fulltext

Bloqueio do receptor de interleucina-6 em pacientes com COVID-19: contextualizando os ensaios clínicos

 Link

https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(21)00273-4?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124721002734%3Fshowall%3Dtrue

As telas de reaproveitamento de drogas revelam vias de entrada específicas do tipo de célula e drogas aprovadas pela FDA ativas contra SARS-Cov-2

LINK

https://www.thelancet.com/journals/lanres/article/PIIS2213-2600(21)00160-0/fulltext

Budesonida inalada no tratamento de COVID-19 precoce (STOIC): um ensaio clínico controlado randomizado de fase 2

 LINK

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/all.14850

Silenciamento de SARS-CoV-2 com formulação de dendrímero de peptídeo de siRNA modificada

University Oxford

https://www.ox.ac.uk/news/2021-02-10-drug-trial-could-improve-respiratory-recovery-covid-19-now-underway

 Ensaio de drogas que podem melhorar a recuperação respiratória de COVID-19 agora em andamento

 LINK https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.02.04.21251134v1

Budesonida inalada no tratamento da doença COVID-19 precoce: um ensaio clínico randomizado


[1] Gilson Lima. É cientista. Aposentou-se depois de décadas de atuação independente sobre múltiplos campos da vida e da tecnologia na complexidade. Hoje atua na ciência como atividade voluntária. Criou a teoria não natural da simbiogênese cooperativa na evolução cérebro, máquinas, corpos e sociedade. Foi por vários anos pesquisador acadêmico e industrial coordenando bancadas de pesquisas de ciência de ponta, tecnologia e protocolos de neuroreabilitação em diferentes cidades e diferentes países principalmente, europeus.

Tem formação original humanística e foi voltando seus estudos e pesquisas desde o início dos anos 90 para a abordagem da complexidade nas metodologias informacionais, depois na nanotecnologia e nos últimos 15 anos de carreira focou na neuroaprendizagem e reabilitação envolvendo a simbiogênese e interfaces colaborativas entre cérebro, corpos e displays.

Inventor de várias tecnologias, softwares e protocolos clínicos.

Escritor. Muitas de suas atividades e textos estão disponíveis no blog: http://glolima.blogspot.com

Atualmente retomou sua atividade como músico compositor, cantor que atuava na adolescência produzindo atualmente suas canções e coordenando a Banda Seu Kowalsky e os Nômades de Pedra. Suas músicas e shows vídeos podem ser acessadas no canal do youtube. https://www.youtube.com/c/seukowalskyeosnomadesdepedra

terça-feira, 13 de julho de 2021

EMERGÊNCIA DAS INTERFACES SIMBIÓTICAS: CRISPR-Cas9

Gilson Lima[1]

  Já ouviu falar em microcirurgias? Sem centro cirúrgico. Sem anestesia e bisturis? Por falar EM EMERGENCIA guardem essa sigla: CRISPR-Cas9

https://www.youtube.com/watch?v=2pp17E4E-O8&t=117s


Da esquerda para a direita: A havaiana Jennifer Doudna & a francesa Emmanuelle Charpentier foram laureadas pelo desenvolvimento de um método de edição do genoma copiado das bactérias. Antes da premiação de 2020, apenas 7 dos 112 Prêmios Nobel da Química haviam sido entregues a mulheres

Resumo: Como as bactérias se livram dos vírus sem um sistema imune?

Algumas bactérias tem um sistema complexo envolto ao RNA que funciona como uma tesoura e no tipo corta e cola resolvem o problema: criam uma adaptação imunológica. Isso gera uma nova forma de edição que permitirá mudar tudo em relação ao enfrentamento de doenças, pragas, pecuária, recuperação ambiental  e tantas outras áreas da vida.


ANTECEDENTES => RNA deixa de ser uma molécula coadjuvante

Estamos todos acostumados desde o projeto GENOMA ver a molécula do DNA estampada nas capas das revistas científicas, mas o RNA não tem essa audiência toda. Ninguém dava nada a molécula de RNA.

Toda a história começou a mudar quando Thomas Cech e Sidney Altman descobriram em 1980 que o DNA não eram as únicas moléculas que poderiam produzir enzimas (o tipo mais fascinante de proteínas), eles descobriram que algumas moléculas de RNA também poderiam ser enzimas. Eles chamaram de robozimas (uma combinação de ácido ribonucleico e enzina).

A história mudou o dogma central da vida. Enquanto no projeto Genoma Humano apostavam todas as cartadas no DNA alguns hereges desviaram da rota e foram estudar o RNA, como Jack Szostak em 1986, sua orientanda Jennifer Doudna e tantos outros como Rodolphe Barrangou e Philippe Horvarth, Virginijus Siksnys e a genial francesa Emmanuelle Charpentier.

CRISPR

Guardem essa sigla. CRISPR. A turma da ciência da vida tem muita dificuldade de batizar nomes A CRIATIVIDADE PARA DIFICULTAR AS COISAS é insuperável.

O mesmo aconteceu aqui com o CRISPR (do inglês Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats), ou seja, Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Interespaçadas. É mole.

Vamos chamar de um symbios – uma interface simbiótica natural que uma bactéria cria para de uma adaptação imunitária. Esse sistema de simbiose; vocês verão que chamarão de Cas9 (CRISPR associated protein 9) que é um ARN guiado a um ADN de uma enzima endonucleática associada com o CRISPR, gerando esse sistema de adaptação imunitária na Streptococcus pyogenes e outras bactérias.

Vamos resumir. Descobrimos que as bactérias tem enzimas de RNA que cortam (como uma tesoura) a estrutura das moléculas dos vírus e os desarmam, incorporam parte deles no seu DNA tornando o vírus inofensivo. Esse sistema é chamado de CRISPR Cas9. Uma simbiótica de adaptação imunitária.

 

Ual. Se as bactérias fazem essa interface simbiótica de adaptação imunitária, por que não podemos fazer?

Já na década de 1980, os cientistas observaram um estranho padrão em alguns genomas bacterianos. Essas repetições foram descritas pela primeira vez em 1987 por Yoshizumi Ishino e colegas da Universidade de Osaka no Japão quando publicaram a sequência de um gene para a bactéria Escherichia coli para entender melhor como o gene trabalhava.

Tinha repetições de agrupamentos eram muito intrigantes até que os cientistas perceberam as sequências únicas, entre as repetições combinava com o DNA de vírus especificamente vírus que atacam as bactérias.

Ficou imediatamente claro que este documento de 1987 serviria de base para cientistas interessados em compreender os mecanismos de sistemas de defesa adaptativas em bactérias e archaea, mas poucos anteciparam os impactos mais amplos de essas descobertas para novas aplicações na engenharia de genoma. Como as bactérias podem incorporar ADN exógeno em outras circunstâncias e até mesmo eliminar o DNA danificado de seu ambiente? Isso num ambiente de laboratório para uma eventual utilização médica. Porém, isso não tornou-se uma ideia viável. 

Há uma série de estudos publicados no início de 2000 discutindo a presença desses sistemas e investigando como eles funcionam.

A partir do ano 2000, repetições agrupamentos semelhantes foram identificadas em adicionais bactérias e archaea e foram denominadas "Repetições Curtas Regularmente Espaçadas" (em inglês: "SRSR"). "SRSR" foi rebatizado como CRISPR em 2002. Um conjunto de genes, algumas proteínas nuclease ou ADN helicase de codificação putativas, foram encontradas sendo associadas com repetições CRISPR (CAS, ou genes associados a CRISPR).

Os trabalhos dessa área estavam fazendo o que é chamado de ciência de base, ou a ciência fundamental, investigando algo para o bem da curiosidade ou interesse - não porque eles sabiam que a investigação teria um resultado prático ou rentável.

 Entretanto, estas observações conduziram à hipótese de que CRISPR são componentes centrais de um sistema imunitário adaptativo, e em 2007 Barrangou forneceu a primeira demonstração de imunidade adaptativa em bactérias através da monitorização loci CRISPR em culturas desafiados por fagos de Streptococcus thermophilus.

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1879625715000425#bib0295

Antes de CRISPR/Cas, a engenharia para uma mutação nas células era cara e trabalhosa. Era comum tese inteira de um aluno ser mudar um gene.

CRISPR evoluiu através da aquisição de fragmentos curtos de ADN derivado de fagos e linhagens novas com espaçadores que são resistentes a estes fagos.

Foi descoberto que CRISPR é uma parte do sistema imunológico das bactérias, a parte que mantém pedaços de vírus perigosos ao redor para que a bactéria possa reconhecer e se defender contra os vírus da próxima vez que eles ataquem. A segunda parte do mecanismo de defesa é um conjunto de enzimas chamadas Cas (CRISPR-associated proteins proteínas associadas ao CRISPR), que podem cortar precisamente DNA e cortam fora vírus invasores. Convenientemente, os genes que codificam o Cas estão sempre estacionados em algum lugar perto as sequências CRISPR.

Em 2009, Emmanuelle Charpenntier que era uma espécie de nômade cientista, estava para deixar Viena e se dirigir a Umea, uma cidade da Suécia situada na província da Västerbotten onde tinha uma trupe que estava estrudando o CRISPR e se aglomerava em torno da Cas9.

Charpenntier estava entusiasmada em descobrir como uma bactéria simples como Streptococcus pyogenes uma espécie de bactéria esférica (por isso coco, de morfologia esférica) e que faz tudo isso sem um poderoso sistema imune como o nosso, como podemos aprender a fazer isso nas interface humana, na nossa rede biótica?

Foi antes de arrumar as malas que se deu conta que depois de que havia um outro componente, um fragmento curto do RNA chamado de Cr RNA. Essa molécula minúscula que facilitava a formação do RNA CRISPR (crRNA) e transportava a memória de um vírus que anteriormente tinha atacado a bactéria e que servia como alça que liga o vírus invasor  para a enzima CAS9 fazer o corte. Assim, em 2010 começa o processo de revelação do tracrRNA.

O crRNA de ativação em trans (tracrRNA). Trasns vem da transcrição.  É um pequeno RNA codificado em trans que ela e sua equipe decobriuram primeiramente na Streptococcus pyogenes.  Na primeira, uma cópia de partes do ácido neucleico invasor é integrada ao locus CRISPR. Depois, os CRISPR RNAs (crRNAs) são transcritos a partir desse locus CRISPR. Os crRNAs são, então, incorporados a complexos efetores, (uma cadeia protéica capaz de um órgão, capaz de reagir ao estímulo dos impulsos nervosos) onde o crRNA guia o complexo por complementariedade a demais cópias de vírus ou plasmídeos invasores, promovendo degradação pelas proteínas Cas.

Há uma variedade de vias para ativação dos sistemas CRISPR, uma das quais utiliza tracrRNAs, que participam da maturação do crRNA. É algo complementar e pareia com pre-crRNAs, formando duplex de RNA. Esse conjunto é clivado pela RNase III, uma ribonuclease específica para RNA, formando um híbrido crRNA/tracrRNA hybrid.

É um conjunto híbrido que age como guia para a endonuclease Cas9, (que faz o corte) e que é capaz de clivar a sequência de ácidos nucleicos alvo.

Charpentier descobriu que o sistema CRISPR-Cas9 cumpria essa missão de defesa contra o vírus usando apenas três componentes: tracrRNA, srRNA e a enzima Cas9. O tracrRNA processava longos trechos de RNA codificados pela sequencia CRISPR  para transformá-los em crRNA; estes, por sua vez, tinham como alvo sequencias específicas do vírusinvasor.

Chapentier que ela mesmo fazer o experimento na bancada, mas não precisou e contou com uma voluntária, uma jovem aluna de mestrado muito dinâmica: a búlgara Elitza Deltcheva. Sua pequena equipe resistiu, mas conseguiu convencer pelo menos um aluno de pós-graduação a trabalhar com a Elitza.

Fizeram o experimento. Eles prepararam um artigo para a Nature em 2011que Elitza Deltcheva foi a autora principal. Os outros colaboradores que resistiram a entrada da atividade voluntária de Elitza ficaram esquecidos na história. Que sirva de lição. Falta ainda ligações para um passo seguinte: isolar cada um dos três componente químicos e descobrir como cada um funciona. Precisava para isso conhecimentos e experimentos com bioquímico estrutural em bancada de pesquisa molecular.

 UM ENCONTRO DE SUCESSO

Março de 2011 Emmanuelle Charpentier e Jennifer Doudna se encontram num hotel em Porto Rico onde participam de uma conferência. Duas personalidades muito diferentes, mas que se afinaram muito rapidamente. Dali saiu o interesse de trabalharem juntos e a constituição de uma pequena equipe de quatro pesquisadores.

Doudna indicou Martin Jinek um biólogo estrutural brilhando que trabalhava em seu laboratório com estruturas de Cas1 e Cas 6 e Emmanuelle Charpentier indicou o biólogo molecular Krzystof Chylinski que permanecera em Viena quando ela se mudou para Umea.

Surgiu aí a pequena equipe que parecia uma ONU: uma professora de Berkeley havaiana (Doudna), seu pós-doutorandio tcheco, uma professora francesa trabalhando na Suécia com seu pós-doutorando polonês trabalhando em Viena.


Da esquerda para a direita: Emmanuelle Charpentier, Jennifer Doudna, Martin Jinek e Krzysztof Chylinsku em Berkeley, 2012.

No começo Jinek e Chylinski não conseguiam fazer o CRISPR cortar o DNA de um vírus dentro do tubo de ensaio com dois componentes: a enzima Cas9 e o RNA CRISPR (CrRNA).  Aí que entra o tracrRNA. Em 2011 Charpendier demonstrou que o tracrRNA era necessário para produzir crRNA guia. Mais tarde suspeitou que ele desempenha um papel ainda maior. Na teoria. Quando acrescentaram o tracrRNA no tubo de ensaio funcionou todas as vezes que o complexo de três componentes cortava o DNA.

Doudna e Charpentier se envolveram diariamente para determinar os componentes essenciais de um sistem CRISPR que corta genes. O gruipo conseguiu decifrar precisamente cada um dos três componenetes essenciais do complexo CRISPR-Cas9. O crRNA contém uma sequência de vinte letras que agem coordenadas para guair o complexo até um pedaço do DNA cuja essência é semelhante. OP tracrRNA, que ajudará a criar o crRNA, tem o papel extra de agor como armação que mantém  os demais componentes no lugar certo em que fixam para atacar o DNA. Feito isso, a Cas9 começa a cortar.

Taí aÍ como a bactéria faz o sistema adaptável da bactéria na interação com o vírus, ele aprende a reconhece-lo e a derrota-lo.

CRISPR COMO FERRAMENTA DE EDIÇÃO NA INTERFACE SIMBIÓTICA

Depois da descoberta do complexo CRISPR-Cas9 essa interface passa agora a borrar o campo da tecnologia, das utilidades práticas. Podemos agora acrescentar um CrRNA diferente e fazer com que ele corte qualquer sequencia desejada, um erro molecular, um vírus,... temos agora um universo a explorar. Provavelmente muito do que nossos organismos fazem para consertar os erros moleculares naturalmente quando dormimos estão de algum modo a nossa mão para podermos interferir com novas “terapias” e micro e nanocirurgias de interfaces simbióticas e ajudarmos também nossos corpos a fazer a tarefa quando ele não consegue sozinho enfrentar doenças tão complicadas como câncer, HIV e tantas outras.


A tecnologia pode ter agora tem dois caminhos: um o de acelerar a ferramenta de interface de modo que ela seja ainda mais simplificada para os diferentes usos  o que logo a seguir a equipe começou a trabalhar ( na fusão de duas moléculas de RNA para um único Cas9) e o segundo ampliar seus usos para diferentes situações antibióticas e de terapias para a nossa parceria com a rede de cooperação da vida.

DE NOVO: A VIDA VIRA NEGÓCIO. ATÉ QUANDO?

É uma dessas verdadeiras Eurekas tão fascinantes que rapidamente em 2020, duas mulheres ganharam juntas, pela primeira vez na história, o Nobel de Química. Jennifer Anne Doudna e Emmanuelle Charpentier foram laureadas pelo desenvolvimento de um método de edição do genoma. Antes da premiação de 2020, apenas 7 dos 112 Prêmios Nobel da Química haviam sido entregues a mulheres. https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2020/prize-announcement/

A ideia é chegar num RNA único que faça todo o serviço (sgRNA). Até então a parceria entre Charpentier e Doudna produzia dois avanços significativos:

1. A descoberta do que o tracrRNA desempenhava um papel essencial na criação do CrRNA-guia, como também , e mais importante, unia-o à enzima Cas9 e ligava todo esse complexo de DNA-alvo para o processo de corte.

2. A invenção de um modo de fundir os dois RNA em um, obtendo o RNA-guia único.

Em 20 de junho de 2012 a revisão de um artigo de 3.500 palavras descrevendo os detalhes precisos como o crRNA e o tracrRNA trabalhavam na proteína Caas-9 ao DNA-alvo estava aprovado pelos editores de Science.

Minha admiração por Charpentier se tornou maior quando logo a seguir ela voltou em conversa para o futuro volta-se a focar na microbiologia básica em vez de ficar procurando novas ferramentas facilitadoras da edição gênica.

No entanto, chegamos ao mundo dos negócios. Jennifer sempre a mais competitiva esforçou-se para a publicação ser o mais rápida possível, que a revisão dos editores de Science tivesse o mínimo de controvérsia. O envio do artigo do pedido da patete de Jennifer foi dia 25 de maio de 2012 e o arquivo enviado para Science foi 8 de junho de 2012. Logo abaixo comento que tinha gente chegando junto, algumas que foram chaves para a descoberta da dupla e é muito estranho que em apenas três semanas do envio do artigo todas as revisões foram feitas e o artigo estava aprovado para publicação. Tudo muito rápido. É o espírito do mercado começa e emergir.

Ou seja, agora temos os interesses do mercado numa ferramenta de interface simbiótica poderosíssima para o uso no processo de acelerarmos a própria evolução simbiótica. O problema agora é que isso virou propriedade. Patente e propriedade envolvendo a vida. Lá vamos nós de novo. A tecnologia não é somente para sonhadores.

Para ser justo com toda a história tem uma parte que precisa ser contata também. Ninguém chega sozinho numa descoberta dessas.

Vimos que já em 2007 – oficialmente pela primeira vez - pesquisadores de iogurte Rodolphe Barrangou e Philippe Horvarth descreveram pela primeira vez como o CRISPR era uma arma de adaptação simbiótica que as bactérias usavam diante dos vírus.

Virginijus Siksnys Lituano, intrigado com esse artigo estudou, pesquisou e em fevereiro de 2009 descreveu com alguns colegas um artigo que mostrava que dentro sistema CRISPR, uma enzima Cas9 guiada por crDNA para cortar um vírus invasor. Esse artigo não foi aceito pelo periódico Cell. Ele mandou para uma espécie de revistas irmã Cell Reports, também foi rejeitado.

Então mandou para a PNAS, publicação da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos. O caminho mais rápido era obter a aprovação de um membro. Em 21 de maio de 2012 enviou um resumo para Jennifer Doudna a fim de obter sua aprovação.

No entanto, no mesmo sentido Doudna concluía seu artigo com Carptinier, por isso se deu por impedida. No entanto, leu o resumo, o que bastou para saber que Siksnys tinha descoberto muito dos mecanismos pelos quais, segundo dizia o resumo: “a clivagem do DNA é executada pela Cas9”. O resumo também afirmava que isso poderia levar a um método de edição de DNA. Esses achados pavimentaria o caminho para a engenharia de endonucleases de DNA guiadas po RNA universalmente programáveis. Esse artigo pode ser obtido no link https://www.pnas.org/content/109/39/E2579. Esse artigo foi recebido pelo PNAS 21 de maio de 2012, assinado por Giedrius Gasiunas, Rodolphe Barrangou, Philippe Horvath e Virginijus Siksnys ele aprovado primeiro de agosto e publicado 4 de setembro de 2012.

Na verdade o pedido de patente de Doudna e o envio do artigo para a Sciene estava sendo preparados bem antes da chegada do resumo de Siksnys. A primeira vista pode parecer suspeito por causadas datas como já disse. Doudna recebeu o resumo dia 21 de maio e o pedido de patente foi 25 de maio.[i] (US 20140068797 A1 (May 25, 2012) .

O arquivo enviado a Science foi 8 de junho. A chegada do resumo apenas acelerou o processo de uma situação competitiva. Competição e cooperação produtiva faz parte da dinâmica da ciência e foi o que aconteceu. Doudna continua a ter uma relação muito amistosa com Barrangou quanto com Siksnys e os dois não viram nada de errado em todo o processo que culminou a primeira publicação do artigo na Sciences.

Teve um rival que questionou a pressa de Doudna: Erick Lander, diretor do Instituto de Broad no MIT e em Haverd. Questionou o fato dela dizer aos editores que tem concorrentes e pedir para apressar a revisão do artigo. Na verdade Lader é conhecido por ser alguém altamente competitivo. Então tanto Doudna e Érico Lander estão em casa com essa ideia de que é assim que a ciência funciona. Não deveria, mas infelizmente a busca de interesses das descobertas se funde com vaidades e vontade de ganhar fama e dinheiro. Quem não sabe disso não conhece nada sobre a pesquisa de ponta, principalmente nas últimas décadas.

O nível da disputa não era necessariamente sem ruídos. Em junho de 2012 Barrangou organizou uma coferência em Berkley sobre o  CRISPR. Carpentinier e

Para quem é simbiótico, como defendo, não temos esse problema. Tudo se resolve em redes de cooperação e não sabemos e nem queremos saber dessa história de patente no conhecimento, muito menos quando isso tem interface com a vida. Seria algo pouco simbiótico.

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ANEXO 

Aplicações.

Aplicações de CRISPR/Cas9 abrangem quase todos os setores envolvendo sistemas biológicos.

 

·         Dr. Bruce Conklin, um geneticista, disse que seu laboratório foi em seguida, febrilmente alterar genes associados a várias doenças cardíacas.

·         Em 2012-2013, pesquisadores falavam que CRISPR/Cas estava causando uma grande reviravolta na investigação biomédica, tal como PCR, o método de amplificação do gene que revolucionou engenharia genética após a sua invenção em 1985. Os pesquisadores esperam usá-lo para ajustar genes humanos para eliminar doenças, criar plantas mais resistentes, limpe patógenos e muito mais. Por exemplo, em 2014, pesquisadores na China relataram o nascimento dos primeiros macacos via bio-engenharia usando mutações direcionadas, uma conquista que poderia ser um trampolim para fazer modelos mais realistas de pesquisa de doenças humanas.

·         Em abril de 2015, quando surgiram as notícias que cientistas haviam usado CRISPR/Cas9 para engenheiria embriões humanos.

·         Em 2017, uma equipe na China corrigiu mutações genéticas em células em três embriões humanos normais usando o CRISPR. Este foi o primeiro o resultado descrito da utilização de CRISPR/Cas em embriões humanos viáveis. Cientistas chineses usaram CRISPR/Cas9 em seres humanos pela segunda vez na história, injetando um paciente com câncer com genes humanos modificados na esperança de vencer a doença.

·         Em junho do mesmo ano, um embriologista em Portland, também teria evitado problemas de edição incompleta e fora do alvo que atormentava tentativas anteriores chinesas.

·         Em 2018, pesquisadores injetaram seu sistema CRISPR/Cas9 em 15 zigotos de macacos rhesus. Eles descobriram que o nocaute MCPH1 foi bem sucedido em 13 dos embriões resultantes (a próxima fase de gestação, quando a célula começa a se dividir e crescer). Isso mostrou que a técnica deles funcionava como eles esperavam e não causa mutações acidentais em macacos.

·         Por outro lado, dois estudos publicados em 2018 descobriram que a edição de células com CRISPR/Cas9 poderia aumentar a chance de que as células sendo alteradas para tratar doenças poderiam se tornar cancerosas ou desencadear o desenvolvimento de câncer em outras células.

·         CRISPR pode melhorar a pontaria de alguns medicamentos contra o câncer que não atingem seu alvo.

·         O cientista chinês He Jiankui ficou conhecido em novembro de 2018,

·         após ter anunciado que teria criado os primeiros humanos geneticamente modificados utilizando a técnica do CRISPR/Cas, causando questões sobre a ética de suas ações.

·          Na agricultura têm obstáculos regulatórios mais baixos do que aplicação biomédicas e alguns desses mercados estão previstos a produzir retornos sobre os investimentos muito rapidamente. Como o desenvolvimento de culturas geneticamente modificadas utilizando Cas9 desde 2016, plantas modificadas com as "tesouras CRISPR/Cas9" têm sido cultivadas, colhidas e cozidas. A refeição com um prato de macarrão que incluiu 300 gramas de repolho.

·         Também pode ser usada para acabar com os pernilongos ou carrapatos transmissores de doenças, eliminar plantas invasoras ou erradicar a resistência a herbicidas em caruri.

·         Para aumentar a produtividade no setor da pecuária. O desenvolvimento rápido e eficiente de pesquisa de animais transgênicos, descoberta de medicamentos, bem como a validação de alvo e de triagem.

·         CRISPR/Cas tem o potencial para se tornar uma força importante na ecologia e conservação, especialmente quando combinada com outras ferramentas de biologia molecular. Pode, por exemplo, ser utilizada para introduzir os genes que lentamente matam as mosquitos que espalham a malária. Ou os genes que colocam os freios na disseminação de espécies invasoras como ervas daninhas. 

Pode vir a ser o próximo grande salto na conservação ou melhoraria do meio ambiente e abrir toda uma nova caixa de riscos

·         Aplicações baseadas em Cas9 na indústria dos setores da saúde humana estão experimentando um crescimento frenético. Estes mercados incluem: geneterapia, terapia celular e imunoterapia.

·         Em junho de 2016, um comité consultivo do National Institutes of Health nos Estados Unidos aprovou uma proposta para usar CRISPR/Cas9 para ajudar a aumentar terapias contra o câncer de pacientes que dependem de alistamento células T.

·         Bebês projetados. CRISPR/Cas9 é uma maneira eficaz de manipular o genoma in vivo em animais, bem como em células humanas in vitro, mas algumas questões com a eficiência de entrega e edição significam que não é considerado seguro para uso em embriões humanos viáveis ou na células germinativas do corpo. Além da maior eficiência do NHEJ, é provável que o CRISPR possa introduzir DSBs em partes não intencionais do genoma, chamadas de efeitos fora do alvo.

·         He Jiankui foi um pesquisador pela universidade chinesa SUSTech, mas ele estava sob licença não remunerada desde fevereiro de 2018. Jiankui pesquisava sobre CRISPR/Cas na universidade. Em novembro de 2018, Jiankui revelou que havia editado o gene CCR5 em dois embriões humanos, com o objetivo de que os bebês não expressassem um receptor para o vírus HIV. As garotas, que o cientista chamou de "Lulu" e "Nana", nasceram poucas semanas antes do anúncio do cientista. A pesquisa foi duramente criticada, sendo considerado um experimento perigoso e prematuro por parte de Jiankui.

 

O que tem sido feito?

 

Terapêutica

Ao longo dos últimos anos, o sistema CRISPR/Cas teve pequenos problemas para a sua utilização terapêutica potencial em terapia génica, com o CRISPR de ARN identificando o alvo da parte relevante de ADN e a proteína Cas clivando. No entanto, o grande problema era o fato de que, para Cas9 para ser eficaz, deveria primeiro ser capaz de entrar nas células alvo de forma eficiente. Desde de 2015, uma equipe de pesquisadores da Carolina do Norete criou e utiliza um veículo de nano escala composto de ADN  para entregar o complexo edição CRISPR/Cas9 em células tanto invitro como in vivo. Quando o nanocomposto – nanoclew entra em contato com uma célula, a célula absorve o nanoclew completamente através de mecanismos típicos de endocitose. Os nanoclews são revestidos com um polímero carregado positivamente, com o fim de quebrar a membrana endossomal e libertar nanoclew no interior da célula. O complexos CRISPR/Cas9, em seguida, libertam-se da estrutura de ADN para abrir caminho para o núcleo. Uma vez que o complexo CRISPR/Cas9 atinge o núcleo, então, a edição do gene pode começar.

Empresas foram fundadas com o objetivo de desenvolver tratamentos que empregam CRISPR/Cas9 para fazer edições em pares de bases individuais e grandes segmentos de ADN. A empresa planeja usar CRISPR para coletar de células-tronco hematopoéticas da medula óssea do paciente, corrigindo um ou mais genes defeituosos com CRISPR/Cas, e depois retornando as células a medula do paciente, que passaria então a produzir glóbulos brancos saudáveis. O seu objetivo para o tratamento de fibrose cística e anemia pela formação de células falciformes, cada um dos quais são causados por mutações de par de bases individual.

Dr. Bence Gyorgy, juntamente está trabalhando com cobaias, em um esforço para desenvolver abordagens baseadas CRISPR/Cas para tratar a doença de Alzheimer e para corrigir a forma genética de surdez. Por volta de agosto de 2015, a tecnologia era mais adequada para a destruição de versões de genes "maus" que causam a doença, mas os cientistas esperam que também seja capaz de substituir essas versões normais com cópias saudáveis do gene.

Em agosto de 2015, pesquisadores da Harvard e do MIT descobriram que o "gene da obesidade" liga a dois outros genes que impedem gordura a ser queimada na forma de calor - um processo chamado termogênese. O estudo revelou que certas variantes no gene FTO fabrica células adiposas de pessoa menos susceptíveis de se tornarem do tipo que queimam energia, e mais provável que seja o tipo que a armazenam como gordura. Anteriormente pensava-se o gene estava relacionado com a obesidade através de efeitos sobre o cérebro relativos ao apetite e a propensão para o exercício. Mas os pesquisadores descobriram que as variantes na verdade amplificam a atividade de outros dois genes - IRX3 e IRX5 - que estão envolvidos em determinar que tipo de células de gordura são produzidas. Os pesquisadores demonstraram que é possível desativar esses genes utilizando a técnica CRISPR/Cas que corta fora o código de DNA "ruim" e o substitui pela seqüência correta.

Em testes, cientistas já foram capazes de reverter problemas genéticos que resultam em cegueiira, puderam parar o avanço de células cancerígenas e até mesmo criaram organismos imunes ao vírus HIV.

Também pesquisadores conseguiram explicar como uma variante de gene promotor de obesidade induz que algumas pessoas engordarem. Usando a ferramenta CRISPR/Cas, eles identificaram um interruptor genético que ajuda a governar o metabolismo do corpo. Os interruptores controlam se das células de gordura comuns queimam a energia, em vez de armazená-la como gordura.

Camundongos já foram usados como modelo na correção do gene mutante da distrofia, evitando o desenvolvimento de distrofia muscular e também no reparo do locus do receptor trnasmembranas da fibrose cística por recombinação homóloga de células-tronco intestinais cultivadas de pacientes humanos com esta doença, evidenciando a CRISPR como técnica promissora para a terapia genética em pacientes humanos.

Os pesquisadores têm utilizado para tratar uma forma grave de distrofia muscular em camundongos. Eles empregaram CRISPR/Cas para cortar a parte de um gene defeituoso com distrofia muscular de Duchenne, permitindo que os animais a fazer uma proteína muscular essencial. A abordagem é a primeira vez que CRISPR foi entregue com sucesso por todo o corpo para o tratamento de animais adultos com uma doença genética.

Cientistas curaram um defeito genético que causa a doença de olho chamada retinite pegmentosa usando a edição CRISPR/Cas9 em células- tronco pluripotentes induzidas derivadas de um paciente com a doença.

Também em um homem na China foi injetado com células imunitárias modificadas que foram preparadas para combater o câncer de pulmão, o primeiro no mundo a receber sangue geneticamente modificado.

Nos Estados Unidos e na Europa, ensaios clínicos foram planejados para várias doenças humanas. Mais notavelmente, um estudo de Fase I / II de edição genética na Europa para beta-talassemia, um distúrbio hereditário do sangue que causa anemia que requer transfusões de sangue ao longo da vida.

Também um teste CRISPR para anemia falciforme, outra doença hereditária do sangue causada por uma mutação que deforma os glóbulos vermelhos, está prevista.

 

Controle de doenças 

Resistência a doenças é uma das aplicações mais populares para CRISPR/Cas na agricultura, e os cientistas estão trabalhando em um amplo espectro de animais. Cientistas esperam que esta ferramenta possa ajudar a conter a perda dramática de abelhas em todo o mundo. Ao manipular os genes, as colônias são menos propensas a sucumbir a ácaros, fungos e outros agentes patogênicos.

O sistema criou CRISPR porcos que são resistentes a doenças virais, incluindo porcos com uma proteína mutada na superfície das suas células, o que deve torná-los impermeáveis a um vírus respiratório mortal. Os pesquisadores estão trabalhando em fazer bovinos resistentes aos parasitas tripanossoma que são responsáveis pela doença do sono.

Pesquisadores defendem que os sistemas CRISPR/Cas têm uma potencial cura para a resistência aos antobióticos usando a menos conhecida enzima, Cas3. Cas9 age como um tipo de tesoura genética, no entanto, Cas3 vai além de Cas9, visando o DNA de células bacterianas e, em seguida, mastigá-las para além do ponto de reparação. Esta ação transforma o sistema imunológico bacteriano baseado em CRISPR nele mesmo, provocando a morte da célula.

Cientistas desenvolveram uma técnica de edição de genes CRISPR que pode potencialmente corrigir a maioria das 3.000 DMD mutações. CRISPR/Cas foi usado para tornar as galinhas resistentes a um vírus comum.

O cientista chinês He Jiankui alegou ter alterado o DNA das meninas gêmeas para torná-las resistentes ao HIV, em 2018, um movimento inovador que provocou questões éticas significativas em torno da edição de genes e dos chamados bebês projetados. A Comissão Nacional de Saúde da China ordenou que as autoridades "investigassem e verificassem seriamente" as alegações do doutor He.

 

Espécie ameaçada 

A técnica CRISPR/Cas9 é um dos métodos mais amplamente propostos para clonagem. O método tem sido aplicado às espécies ameaçadas e há vários esforços para trazer de volta o amute-lanoso além de oportunidades com animais como ursos, e também em aves.

Pesquisadores da Universidade de Stanford criaram o primeiro coral geneticamente modificado usando o CRISPR para editar três genes em corais que crescem na Grande Barreira de Corais da Austrália. Dois dos genes são responsáveis pela coloração do recife e um está envolvido na regulação de como o novo coral se instala e cresce em um recife. Usando CRISPR demonstrou-se que os embriões resultantes continham os genes mutados. Os resultados sugerem que o CRISPR poderia ser usado para, eventualmente, ajudar os cientistas a manipular os genes para que possam se tornar mais resistentes ao branqueamento causado por estresses ambientais como o aquecimento global e a poluição.

 

Lacticínios 

Danisco (DuPont) foi um dos pioneiros na utilização comercial da tecnologia CRISPR/Cas para aumentar a imunidade viral em bactérias utilizadas para fazer iogurtes e queijo, mas outros mercados vêm emergindo rapidamente. DuPont utiliza CRISPR para desenvolver culturas naturais com uma estrutura interna de imunidade aos fagos que geralmente atacam durante a produção de queijo. Ao contrário das culturas utilizadas para rotações convencionais em fábricas lácteos fermentados, "CHOOZIT" são caracterizados pela suas idênticas funcionalidade permitindo que cada membro da rotação execute exatamente da mesma maneira. A única diferença reside na sua imunidade a fagos. Os principais benefícios incluem melhorias de produtividade, otimização de tempo de processo e minimização de "downgrades" de produtos, graças a inovação técnica CRISPR que permite a rotação de culturas, sem variabilidade indesejada.

 

Pecuária 

Dr. Scott Fahrenkrug de Recombinetics anunciou, em julho de 2015, que desenvolveu uma maneira de editar os genes de animais para mudar traços específicos, tanto para usos agrícolas e biomédicos. Ele desenvolveu uma forma de editar os genes de animais de fazenda para alterar características específicas. Ele podem editar o traço que faz crescer chifres no gado. Isso significa que uma vaca não nasce com chifres, e nunca precisa se submeter ao processo sangrento de descorna. Usando o método CRISPR/Cas, os investigadores podem fazer que uma parte pequena do genoma do gado leiteiro assemelhar-se o genoma de sem chifres gado Red Angus. Isso significa que eles podem remover seus chifres sem fazer quaisquer outras alterações genéticas. Um outro exemplo do uso de CRISPR para mudar traços específicos é o caso do trabalho com células musculares em porcos. Os bovinos Belga Azul são enormes e fortes animais que fornecem excepcionalmente grandes quantidades de valorizado, cortes magros de carne, resultado de décadas de cruzamentos seletivos, porém, uma equipe de cientistas da China, através da edição de um único gene criaram o equivalente suíno utilizando o método TALENs de edição genética que, muito mais rapidamente, introduz uma mutação no gene da miostatina em células fetais de porco que faz com que células musculares se multiplicarem.

 

Agricultura 

Cientistas de todo o mundo vêm tentando produzir trigo, a cultura mais comum do planeta, capaz de sobreviver a doenças causadas por fungos através da introdução de genes resistentes a doenças, mas, no passado, era difícil adicionar mais de dois ou três desses genes. de uma vez. Um estudo piloto, de 2018, sobre uma tecnologia inovadora chamada GAANTRY (Gene Assembly in Agrobacterium by Nucleic acid Transfer using Recombinase technologY) que pode inserir uma grande quantidade de múltiplos genes simultaneamente em plantas.

Cientistas desenvolveram um cogumelo na universidade da Pensilvânia, que não escurece. Esses cogumelos não serão regulamentados como organismos transgênicos, uma vez que não contém ADN exógeno e a edição genética CRISPR está movendo as plantações de tomate do campo para da cidade, ou mesmo para o espaço sideral.[115]

O uso do editor CRISPR para melhorar certas variedades de culturas, como trigo e milho, permaneceu difícil por anos por causa das duras paredes celulares das plantas. Em 2019, uma grande empresa agrícola resolveu esse problema usando o pólen de uma planta geneticamente modificada para transportar os componentes CRISPR para as células de outra planta. A solução promete acelerar a criação de melhores e mais versáteis culturas.

 

Armazenamento de imagens

Pesquisadores usaram o sistema imunológico microbiano CRISPR/Cas para codificar um filme no genoma da bactéria Escherichia coli. Para desenvolver esse sistema, no entanto, os pesquisadores tiveram que estabelecer um método para gravar centenas de eventos em uma célula. Eles exploraram a capacidade de capturar fragmentos de DNA de invasão de vírus e armazená-los em uma matriz organizada no genoma do hospedeiro. Na natureza, esses fragmentos visam uma enzima para cortar o DNA do invasor. O filme que os pesquisadores selecionaram consistiu em cinco quadros adaptados da série de "Locomoção Humana e Animal" do fotógrafo britânico Eadweard Muybridge. As fotos mostram uma égua chamada Annie G. galopando em 1887.

 

Método de pesquisa

Esta tecnologia também permite aos cientistas pintar um cromossoma inteiro e olhá-lo ao vivo e realmente segui-lo no núcleo  durante o ciclo celular ou como ele passa por transições de desenvolvimento, por exemplo, em um embrião, para ver como ele muda de tamanho e estrutura. O processo, que os cientistas se referem como "CRISPR-EATING" é relatado em um artigo da revista "Developmental Cell", que mostra, como prova de princípio, que os pesquisadores transformaram o genoma inteiro de uma bactéria comum do intestino E. coli para uma biblioteca de 40 mil guias de ARN que cobriam 88 por cento do genoma bacteriano.

Pesquisadores chineses relataram a edição os genomas de embriões humanos. Os resultados, que estão publicados na revista "Protein on-line & Cell", demonstraram um número surpreendente de mutações "fora de alvo" que se presume serem introduzidas pelo complexo CRISPR/Cas9 atuando em outras partes do genoma. Este efeito é uma das principais preocupações de segurança que rodeiam edição da linha germinado gene, porque estas mutações não intencionais podiam ser prejudiciais. As taxas de tais mutações foram muito superiores do que as observados em gene de edição de embriões de ratos ou células adultas humanas e confirmam rumores de que tais experimentos foram conduzidos. Isto provocou um debate, em abril de 2015, sobre as implicações éticas de tal trabalho.

Pesquisadores da Universidade de Harvard e do Instituto de Tecnologia de Massachusetts desenvolveram uma nova abordagem que permite aos pesquisadores conseguir o uso de duas variantes da proteína Cas9 para executar qualquer passos de tarefas, edição ou regulação do gene usando um único Cas9 isoforme. A equipe de Harvard-MIT descobriu que o comprimento da sequência de ARN guia desempenha um papel fundamental na determinação do destino de Cas9, se ele apenas se liga ao ADN ou se extirpa o ARN também. Este novo método CRISPR também pode ser utilizado na produção metabólica em grande escala de produtos químicos e combustíveis utilizando bactérias geneticamente modificadas, simultaneamente salvaguardando as biofábricas microbianas de infecção por agentes patogênicos estranhos.

Pesquisadores do Hospital de Câncer Infantil de Boston acreditam que as mudanças de um pequeno pedaço de ADN na região intensificadora do gene Linfma/leuciomia 11ª de células B pode contornar o defeito genético que é subjacente á doença de células falciformes e possivelmente outras doenças do sangue como a talassemia. Numa tentativa de imitar e melhorar as variações naturais, os investigadores desenvolveram ferramentas de edição de genes à base de CRISPR para cortar sistematicamente pequenas as seções de ADN passo-a-passo ao longo de todo o comprimento do intensificador em células estaminais do sangue a partir de doadores humanos. A equipe em seguida deixou as células amadurecerem para células vermelhas do sangue e descobriram que a quantidade de hemoglobina fetal das células produzidas tinham aumentado drasticamente. Além disso, os cientistas descobriram um local específico no intensificador que, quando o cortado, conduz à produção de níveis elevados de hemoglobina fetal.

Uma equipe de cientistas conseguiu inativar o HIV geneticamente em camundongos, reduzindo a expressão do RNA viral em cerca de 60 a 90%. Em seguida, eles conseguiram usar o CRISPR em roedores infectados com um tipo de HIV equivalente ao humano.

Usando CRISPR, os pesquisadores criaram uma técnica para estudar o desenvolvimento de mamíferos que permite tomar o estágio final de desenvolvimento de um organismo modelo e de lá reconstruir uma árvore de linhagem completa até o estágio de célula única.

Em 2019, pesquisadores descobriram uma maneira de usar a ferramenta CRISPR/Cas9 em répteis.

Ensaio clínico

Em 2019, na primeira série de ensaios clínicos, os cientistas estão usando CRISPR/Cas9 para combater o câncer e distúrbios sangüíneos em pessoas. Nesses testes, os pesquisadores removem algumas células de uma pessoa, editam o DNA e, em seguida, injetam as células de volta, agora esperamos que estejam armadas para combater as doenças. Os pesquisadores também estão preparados para ver como o CRISPR/Cas9 funciona dentro do corpo humano. Em um próximo teste, pessoas com uma cegueira herdada terão a tesoura molecular injetada em seus olhos.

CRISPR optogenético

CRISPR optogenético é uma nuclease Cas9 ativada por luz que oferece aos investigadores maior controle espacial e temporal sobre a atividade de nuclease guiada por ARN. Assim, proporcionando extremamente preciso da edição de genes. Em células humanas, paCas9, um manipulado Cas9 fotoativável permite o controle optogenético da edição do genoma CRISPR/Cas9. O paCas9 consiste em fragmentos de Cas9 divididos e domínios de dimerização foto-indutíveis denominados "ímãs". A atividade de edição do genoma pode ser desligada simplesmente apagando a luz e também a ativação de paCas9 em amostras espaciais determinadas pelos locais de irradiação.

Ética e ações regulatórias 

Quando os cientistas na China relataram a realização do primeiro experimento usando a edição CRISPR de genomas para alterar o DNA de embriões humanos, potencialmente afetando a linha germinal, inflamou ainda mais o protestos de cientistas que advertem que tal passo, atravessou uma linha ética. Este anúncio tocou os sinos de alarme éticos, não apenas religiosos obcecados e transgênicos cautelares, mas de um grupo de 18 proeminentes cientistas e especialistas em direito e ética que publicou uma carta pedindo uma moratória sobre alguns usos dessa tecnologia.

Os cientistas afirmam que a técnica de edição CRISPR pode modificar os genomas dos seres humanos e outras espécies de uma forma que poderia ter "efeitos imprevisíveis sobre as gerações futuras" e "implicações profundas para a nossa relação com a natureza".

Independente da controvérsia, cientistas do Instituto Francis Crick pediram ao órgão regulador do Reino Unido de tratamento e pesquisa de fertilidade, para obter uma licença para conduzir edição de gene CRISPR/Cas9 em embriões para um estudo de investigação sobre por que algumas mulheres têm aborto espontâneo, e em janeiro de 2016, a permissão para editar os genomas de embriões humanos para a pesquisa foi concedida para os cientistas em Londres. A avaliação de ameaça global divulgada em 2016, pelo diretor nacional de inteligência dos EUA, colocou esta edição de genoma entre uma das seis ameaças listadas na seção sobre as armas de destruição em massa.

A técnica com proteínas anti-CRISPR (que anulam o efeito de CRISPR/Cas9 utilizando proteínas que são produzidas por vírus bacterianos) foram descobertas e podem ser usadas em bactérias - como E. coli - bem como em células humanas modificadas. O anti-CRISPR tem o potencial de melhorar a segurança e a precisão das aplicações CRISPR tanto no uso clínico como na pesquisa básica; assim, reduzindo as principais preocupações éticas e a necessidade de ações regulatórias da técnica CRISPR.

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Investimento

Em 2015, Jennifer Doudna, um bioquímica da Universidade da Califórnia co-fundadora de "Editas Medicine", e sua colaboradora, Emmanuelle Charpentier do Centro Helmholtz para Pesquisa de Infecções na Alemanha, receberam $3 milhões de dólares cada uma pela invenção da revolucionária ferramenta para a edição de DNA CRISPR. Em agosto de 2015, Bill Gates e 13 outros investidores colocaram $120 milhões em "Editas Medicine" e em setembro, Intellia Therapeutics, que desenvolveu maneiras de corrigir os genes defeituosos com tratamentos de edição de genes para doenças do fígado e do sangue, recebeu $70 milhões de investidores.

O ODIN (ou "Open Discovery Institute"), um dos projetos do Indiegogo, tentando facilitar e incentivar a investigação em biologia sintética em casa, o "faça você mesmo", está vendendo kits completos de engenharia de genoma para que cientistas amadores e fãs possam experimentar a edição de repetições palindrômicas curtas de gene por si próprios. 



[1] Gilson Lima. É cientista. Aposentou-se depois de décadas de atuação independente sobre múltiplos campos da vida e da tecnologia na complexidade. Hoje atua na ciência como atividade voluntária. Criou a teoria não natural da simbiogênese cooperativa na evolução cérebro, máquinas, corpos e sociedade. Foi por vários anos pesquisador acadêmico e industrial coordenando bancadas de pesquisas de ciência de ponta, tecnologia e protocolos de neuroreabilitação em diferentes cidades e diferentes países principalmente, europeus.

Tem formação original humanística e foi voltando seus estudos e pesquisas desde o início dos anos 90 para a abordagem da complexidade nas metodologias informacionais, depois na nanotecnologia e nos últimos 15 anos de carreira focou na neuroaprendizagem e reabilitação envolvendo a simbiogênese e interfaces colaborativas entre cérebro, corpos e displays.

Inventor de várias tecnologias, softwares e protocolos clínicos.

Escritor. Muitas de suas atividades e textos estão disponíveis no blog: http://glolima.blogspot.com

Atualmente retomou sua atividade como músico compositor, cantor que atuava na adolescência produzindo atualmente suas canções e coordenando a Banda Seu Kowalsky e os Nômades de Pedra. Suas músicas e shows vídeos podem ser acessadas no canal do youtube. https://www.youtube.com/c/seukowalskyeosnomadesdepedra



[i] Methods and compositions for rna-directed target dna modification and for rna-directed modulation of transcription Pat: US 20140068797 A1 (May 25, 2012)

Em abril de 2014, uma patente aberta, nos EUA, foi atribuída a Feng Zhang, um cientista do Instituto "Broad" MIT-Harvard que afirma ter descoberto a eficácia das CRISPR/Cas9 na edição de genes em células humanas. Zhang apresentou sua patente com a data de prioridade de dezembro de 2012. Apenas alguns meses mais tarde, o prêmio "Breakthrough" foi atribuído a J. Doudna e E. Charpentier pela contribuição para a descoberta de CRISPR. Doudner e Charpentier registraram uma patente com a data de prioridade de 25 de maio de 2012, que inclui 155 reivindicações, englobando inúmeras aplicações do sistema para uma variedade de tipos de células.

Todas as partes nesta disputa fundaram empresas de biotecnologia na corrida para desenvolver CRISPR como medicamento clínico viável. Zhang co-fundou Editas Medicine com Doudner antes desistir e vir a fundar Caribou Biosciences e Intellia Therapeutics.[158] Charpentier é a fundadora da CRISPR Therapeutics, mas já vendeu os direitos dessa empresa. Feng Zhang ganhou os direitos de patente depois de apresentar provas de que ele foi o primeiro a elaborar editores de genes baseados em CRISPR.

Caribou Biosciences, uma empresa co-fundada por Jennifer Doudna, em 2016, passou a defender que a patente dela é diferente das patentes e pedidos de patentes que estão no centro da luta de patentes CRISPR que coloca o Instituto Broad do MIT e Harvard contra um grupo liderado por Doudna. Entretanto, em fevereiro de 2016, a Caribou e a Integrated DNA Technologies, Inc. (IDT), firmaram um contrato de licença não-exclusiva, em que Caribou concedeu direitos mundiais a IDT para comercializar os reagentes CRISPR/Cas9 sob a propriedade intelectual da Caribou.

Várias disputas surgiram por conta destes pedidos de patentes rivais. Mais de 100 patentes já foram pedidas por muitos cientistas que fazem uso da tecnologia CRISPR/Cas9. Isso pode levar muitos cientistas a violações de patentes cada vez que produtos CRISPR/Cas9 foram licenciados.

No início de 2017, o escritório de patentes dos EUA regularizou as patentes CRISPR em disputa. Em um julgamento de uma sentença, três juízes decidiram que "não há interferência de fato". Em outras palavras, as patentes CRISPR chaves, concedidas no início para a "Broad" (MIT-Harvard) em 2014, são suficientemente diferentes das patentes solicitadas pela UC. A decisão também teve grandes conseqüências para uma falange de companhia startups em biotecnológicas que correm para comercializar a tecnologia CRISPR.

Entretanto, para muitos pesquisadores a patente para CRISPR/Cas9 em si, dada a uma empresa, pode ser controversa. Uma vez que a tecnologia utiliza uma técnica que já existe em bactérias por milênios, parece ser "óbvio" para muitos cientistas que podem facilmente usá-la em seus laboratórios. Em um sentido CRISPR foi de fato "inventado" pela natureza e não por qualquer indivíduo, assim reivindicando uma patente sobre o mecanismo que seria um ato natural da bactéria. Respondendo a uma questão como essa pode ser uma grande dor de cabeça não só para o campo jurídico, mas também para a bioética e a filosofia.


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CRISPR (do inglês Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats

Vamos lá.

Repetições palindrômicas. Palíndromo é uma palavra, frase ou número que permanece igual quando lida de trás para diante. Por extensão, palíndromo é qualquer série de elementos com simetria linear, ou seja, que apresenta a mesma sequência de unidades nos dois sentidos.

A palavra "palíndromo" vem do grego palin (πάλιν, "para trás, novamente") + dromos (δρόμος, "caminho, rua") - que corre em sentido inverso. Mas o termo foi cunhado em inglês (palindrome), no século XVII, e os primeiros a utilizá-lo foram os escritores Henry Peacham em 1638 de quem não sabemos quase nada sobre e depois consolidado por Bem Jonson (1640) um dramaturgo, poeta e ator inglês que atuou na renascença.

Uma palavra palíndroma é aquela cuja sequência de letras é simétrica, permitindo uma leitura idêntica da esquerda para a direita ou da direita para a esquerda: ovo, ossoreleranilina.

Na genética consiste em pequenas porções do DNA bacteriano compostas por repetições de nucleotídeos (blocos construtores dos ácidos nucleicos, o DNA e o RNA).

Cada uma dessas repetições encontra-se adjacente a um “protoespaçador” (“espaçador de DNA”), que corresponde a uma região não-codificante inserida no DNA bacteriano após o contato com genomas invasores provenientes de bacteriófagos (vírus) ou plasmídeos (moléculas circulares duplas de DNA capazes de se reproduzir independentemente do DNA cromossômico. Ocorrem geralmente em bactérias e por vezes também em organismos eucarióticos unicelulares e células de eucariotas superiores).

A transcrição (o modo como é expressa o locus CRISPR (em genética, lócus é uma posição fixa e específica em um cromossomo, onde está localizado determinado gene ou marcador genético. Cada cromossomo carrega muitos genes, com cada gene ocupando uma posição ou locus diferente), .... então voltando, nessa interação com o patógeno se resulta pequenos fragmentos de RNA (essa molécula de ácido ribonucleico) com capacidade de desempenhar o reconhecimento de um DNA exógeno específico e atuar como um guia de modo a orientar a nucleasse Cas (nucleases são enzimas capazes de quebrar as ligações entre os nucleotídeos - grupo fosfato, uma pentose (açúcar) e uma base nitrogenada (adenina, guanina, citosina, timina ou uracila) - que são subunidades do ácido nucleico. As enzimas responsáveis pela degradação de DNA são denominadas desoxirribonucleases (DNases) e as responsáveis pela degradação de RNA são chamadas ribonucleases -(RNAses)), o Cas (CRISPR associated protein 9) é um ARN guiado a um ADN de uma enzima endonucleática associada com o CRISPR do sistema de adaptação imunitária em Streptococcus pyogenes, ou outras bactérias. ... voltando.... essa enzima que irá promover a clivagem e consequente eliminação do DNA invasor caso este entre novamente em contato com a bactéria, atuando como importante mecanismo de defesa contra DNAs invasores.